PlantTFDB
PlantRegMap/PlantTFDB v5.0
Plant Transcription Factor Database
Previous version: v3.0 v4.0
Oryza sativa f. spontanea
Transcription Factors
The gene annotaion from EnsemblPlants(v43) is used to identify transcription factors (TFs) of Oryza sativa f. spontanea (See datasource). Acorrding to the family assignment rules,
2147
TFs (
1715
loci) are identified and classified into
56
 families. You can download the TF list (here) and protein sequences of TFs (here), or download them on the download page.
Browse by Family
AP2 (38) ARF (38) ARR-B (10) B3 (66) BBR-BPC (7)
BES1 (8) C2H2 (120) C3H (65) CAMTA (18) CO-like (19)
CPP (23) DBB (11) Dof (32) E2F/DP (12) EIL (8)
ERF (143) FAR1 (16) G2-like (66) GATA (31) GRAS (65)
GRF (15) GeBP (13) HB-PHD (2) HB-other (15) HD-ZIP (49)
HRT-like (1) HSF (28) LBD (40) LFY (1) LSD (12)
M-type_MADS (41) MIKC_MADS (57) MYB (95) MYB_related (84) NAC (168)
NF-X1 (3) NF-YA (19) NF-YB (17) NF-YC (17) Nin-like (27)
RAV (4) S1Fa-like (3) SBP (33) SRS (4) STAT (4)
TALE (34) TCP (24) Trihelix (39) VOZ (2) WOX (14)
WRKY (121) Whirly (4) YABBY (12) ZF-HD (17) bHLH (199)
bZIP (133)