PlantTFDB
PlantRegMap/PlantTFDB v5.0
Plant Transcription Factor Database
Previous version: v3.0 v4.0
Herrania umbratica
Transcription Factors
The gene annotaion from NCBI(v100) is used to identify transcription factors (TFs) of Herrania umbratica (See datasource). Acorrding to the family assignment rules,
1833
TFs (
1256
loci) are identified and classified into
57
 families. You can download the TF list (here) and protein sequences of TFs (here), or download them on the download page.
Browse by Family
AP2 (26) ARF (28) ARR-B (12) B3 (65) BBR-BPC (9)
BES1 (12) C2H2 (81) C3H (57) CAMTA (8) CO-like (15)
CPP (7) DBB (10) Dof (25) E2F/DP (17) EIL (1)
ERF (97) FAR1 (73) G2-like (62) GATA (26) GRAS (52)
GRF (10) GeBP (5) HB-PHD (4) HB-other (15) HD-ZIP (42)
HRT-like (1) HSF (28) LBD (37) LFY (1) LSD (5)
M-type_MADS (34) MIKC_MADS (54) MYB (140) MYB_related (81) NAC (107)
NF-X1 (3) NF-YA (19) NF-YB (21) NF-YC (16) NZZ/SPL (1)
Nin-like (18) RAV (4) SAP (1) SBP (33) SRS (5)
STAT (3) TALE (27) TCP (28) Trihelix (35) VOZ (4)
WOX (12) WRKY (69) Whirly (2) YABBY (12) ZF-HD (14)
bHLH (165) bZIP (94)