PlantTFDB
PlantRegMap/PlantTFDB v5.0
Plant Transcription Factor Database
Previous version: v3.0 v4.0
Cynara cardunculus var. scolymus
Transcription Factors
The gene annotaion from NCBI is used to identify transcription factors (TFs) of Cynara cardunculus var. scolymus (See datasource). Acorrding to the family assignment rules,
2512
TFs (
1850
loci) are identified and classified into
58
 families. You can download the TF list (here) and protein sequences of TFs (here), or download them on the download page.
Browse by Family
AP2 (32) ARF (48) ARR-B (13) B3 (59) BBR-BPC (6)
BES1 (15) C2H2 (138) C3H (81) CAMTA (19) CO-like (17)
CPP (5) DBB (13) Dof (45) E2F/DP (8) EIL (10)
ERF (180) FAR1 (120) G2-like (72) GATA (37) GRAS (76)
GRF (17) GeBP (13) HB-PHD (4) HB-other (11) HD-ZIP (70)
HRT-like (1) HSF (36) LBD (49) LFY (1) LSD (10)
M-type_MADS (37) MIKC_MADS (72) MYB (179) MYB_related (103) NAC (109)
NF-X1 (3) NF-YA (17) NF-YB (23) NF-YC (16) NZZ/SPL (1)
Nin-like (15) RAV (3) S1Fa-like (2) SAP (1) SBP (27)
SRS (9) STAT (3) TALE (38) TCP (43) Trihelix (68)
VOZ (6) WOX (14) WRKY (101) Whirly (2) YABBY (12)
ZF-HD (22) bHLH (215) bZIP (165)