PlantTFDB
PlantRegMap/PlantTFDB v5.0
Plant Transcription Factor Database
Previous version: v3.0 v4.0
Coffea arabica
Transcription Factors
The gene annotaion from NCBI(v100) is used to identify transcription factors (TFs) of Coffea arabica (See datasource). Acorrding to the family assignment rules,
3750
TFs (
2483
loci) are identified and classified into
57
 families. You can download the TF list (here) and protein sequences of TFs (here), or download them on the download page.
Browse by Family
AP2 (44) ARF (42) ARR-B (44) B3 (174) BBR-BPC (21)
BES1 (14) C2H2 (189) C3H (111) CAMTA (15) CO-like (17)
CPP (12) DBB (18) Dof (38) E2F/DP (18) EIL (9)
ERF (192) FAR1 (297) G2-like (112) GATA (51) GRAS (155)
GRF (16) GeBP (14) HB-PHD (5) HB-other (27) HD-ZIP (75)
HRT-like (6) HSF (62) LBD (75) LFY (2) LSD (16)
M-type_MADS (78) MIKC_MADS (115) MYB (205) MYB_related (146) NAC (183)
NF-X1 (11) NF-YA (39) NF-YB (42) NF-YC (36) Nin-like (65)
RAV (6) S1Fa-like (1) SAP (1) SBP (38) SRS (7)
STAT (2) TALE (54) TCP (50) Trihelix (72) VOZ (5)
WOX (25) WRKY (114) Whirly (4) YABBY (11) ZF-HD (19)
bHLH (382) bZIP (168)