PlantTFDB
Plant Transcription Factor Database
v4.0
Previous version: v1.0, v2.0, v3.0
Setaria viridis
Transcription Factors
The gene annotaion from JGI(v1.1) is used to identify transcription factors (TFs) of Setaria viridis (See datasource). Acorrding to the family assignment rules,
2765
TFs (
1871
loci) are identified and classified into
56
 families. You can download the TF list (here) and protein sequences of TFs (here), or download them on the download page.
Browse by Family
AP2 (34) ARF (43) ARR-B (18) B3 (93) BBR-BPC (9)
BES1 (7) C2H2 (141) C3H (70) CAMTA (18) CO-like (18)
CPP (21) DBB (10) Dof (41) E2F/DP (21) EIL (9)
ERF (188) FAR1 (96) G2-like (74) GATA (39) GRAS (64)
GRF (13) GeBP (16) HB-PHD (8) HB-other (16) HD-ZIP (63)
HRT-like (2) HSF (38) LBD (33) LFY (1) LSD (8)
M-type_MADS (35) MIKC_MADS (64) MYB (170) MYB_related (137) NAC (205)
NF-X1 (3) NF-YA (39) NF-YB (24) NF-YC (23) Nin-like (29)
RAV (4) S1Fa-like (2) SBP (37) SRS (8) STAT (2)
TALE (46) TCP (25) Trihelix (73) VOZ (2) WOX (13)
WRKY (142) Whirly (2) YABBY (15) ZF-HD (21) bHLH (271)
bZIP (161)