PlantTFDB
Plant Transcription Factor Database
v4.0
Previous version: v1.0, v2.0, v3.0
Setaria italica
Transcription Factors
The gene annotaion from JGI(v2.2) is used to identify transcription factors (TFs) of Setaria italica (See datasource). Acorrding to the family assignment rules,
2410
TFs (
1900
loci) are identified and classified into
56
 families. You can download the TF list (here) and protein sequences of TFs (here), or download them on the download page.
Browse by Family
AP2 (30) ARF (38) ARR-B (14) B3 (72) BBR-BPC (7)
BES1 (10) C2H2 (130) C3H (59) CAMTA (9) CO-like (16)
CPP (13) DBB (12) Dof (37) E2F/DP (13) EIL (6)
ERF (183) FAR1 (86) G2-like (65) GATA (37) GRAS (62)
GRF (13) GeBP (16) HB-PHD (2) HB-other (15) HD-ZIP (57)
HRT-like (2) HSF (36) LBD (34) LFY (1) LSD (8)
M-type_MADS (32) MIKC_MADS (51) MYB (155) MYB_related (114) NAC (165)
NF-X1 (2) NF-YA (24) NF-YB (20) NF-YC (20) Nin-like (25)
RAV (6) S1Fa-like (1) SBP (27) SRS (5) STAT (2)
TALE (43) TCP (26) Trihelix (56) VOZ (2) WOX (13)
WRKY (126) Whirly (2) YABBY (15) ZF-HD (21) bHLH (233)
bZIP (141)