PlantTFDB
Plant Transcription Factor Database
v4.0
Previous version: v1.0, v2.0, v3.0
Oryza sativa subsp. japonica
Transcription Factors
The gene annotaion from MSU(v7) is used to identify transcription factors (TFs) of Oryza sativa subsp. japonica (See datasource). Acorrding to the family assignment rules,
2408
TFs (
1862
loci) are identified and classified into
56
 families. You can download the TF list (here) and protein sequences of TFs (here), or download them on the download page.
Browse by Family
AP2 (22) ARF (48) ARR-B (11) B3 (65) BBR-BPC (7)
BES1 (6) C2H2 (135) C3H (74) CAMTA (7) CO-like (21)
CPP (20) DBB (13) Dof (37) E2F/DP (10) EIL (11)
ERF (163) FAR1 (133) G2-like (62) GATA (32) GRAS (69)
GRF (19) GeBP (13) HB-PHD (1) HB-other (17) HD-ZIP (61)
HRT-like (1) HSF (38) LBD (39) LFY (2) LSD (12)
M-type_MADS (35) MIKC_MADS (61) MYB (130) MYB_related (106) NAC (170)
NF-X1 (2) NF-YA (25) NF-YB (16) NF-YC (19) Nin-like (15)
RAV (4) S1Fa-like (2) SBP (29) SRS (6) STAT (1)
TALE (45) TCP (23) Trihelix (40) VOZ (2) WOX (17)
WRKY (128) Whirly (2) YABBY (15) ZF-HD (15) bHLH (211)
bZIP (140)