PlantTFDB
Plant Transcription Factor Database
v4.0
Previous version: v1.0, v2.0, v3.0
Oryza nivara
Transcription Factors
The gene annotaion from OGE is used to identify transcription factors (TFs) of Oryza nivara (See datasource). Acorrding to the family assignment rules,
2147
TFs (
1715
loci) are identified and classified into
56
 families. You can download the TF list (here) and protein sequences of TFs (here), or download them on the download page.
Browse by Family
AP2 (38) ARF (38) ARR-B (10) B3 (66) BBR-BPC (7)
BES1 (8) C2H2 (120) C3H (65) CAMTA (18) CO-like (19)
CPP (23) DBB (11) Dof (32) E2F/DP (12) EIL (8)
ERF (143) FAR1 (16) G2-like (66) GATA (31) GRAS (65)
GRF (15) GeBP (13) HB-PHD (2) HB-other (15) HD-ZIP (49)
HRT-like (1) HSF (28) LBD (40) LFY (1) LSD (12)
M-type_MADS (41) MIKC_MADS (57) MYB (95) MYB_related (84) NAC (168)
NF-X1 (3) NF-YA (19) NF-YB (17) NF-YC (17) Nin-like (27)
RAV (4) S1Fa-like (3) SBP (33) SRS (4) STAT (4)
TALE (34) TCP (24) Trihelix (39) VOZ (2) WOX (14)
WRKY (121) Whirly (4) YABBY (12) ZF-HD (17) bHLH (199)
bZIP (133)