PlantTFDB
Plant Transcription Factor Database
v4.0
Previous version: v1.0, v2.0, v3.0
Capsella rubella
Transcription Factors
The gene annotaion from JGI(v1.0) is used to identify transcription factors (TFs) of Capsella rubella (See datasource). Acorrding to the family assignment rules,
1898
TFs (
1743
loci) are identified and classified into
58
 families. You can download the TF list (here) and protein sequences of TFs (here), or download them on the download page.
Browse by Family
AP2 (18) ARF (21) ARR-B (17) B3 (69) BBR-BPC (9)
BES1 (10) C2H2 (108) C3H (60) CAMTA (7) CO-like (16)
CPP (8) DBB (8) Dof (39) E2F/DP (8) EIL (6)
ERF (126) FAR1 (22) G2-like (55) GATA (35) GRAS (39)
GRF (8) GeBP (19) HB-PHD (4) HB-other (8) HD-ZIP (53)
HRT-like (3) HSF (31) LBD (47) LFY (1) LSD (4)
M-type_MADS (87) MIKC_MADS (43) MYB (157) MYB_related (73) NAC (119)
NF-X1 (2) NF-YA (12) NF-YB (12) NF-YC (14) NZZ/SPL (1)
Nin-like (18) RAV (5) S1Fa-like (3) SAP (2) SBP (19)
SRS (9) STAT (3) TALE (24) TCP (27) Trihelix (34)
VOZ (2) WOX (15) WRKY (78) Whirly (4) YABBY (7)
ZF-HD (18) bHLH (163) bZIP (88)